Tema: PENDIDIKAN BERKUALITI DAN PEMBANGUNAN SWADYA INSAN
Subtema Seminar Pendidikan Johor 2016 tidak hanya tertakluk kepada subtema yang tersenarai di bawah:
Sub-tema:
a) Pembangunan pendidikan yang holistik
b) Perkembangan pendidikan belia
c) Pendidikan Sukan dan bakat muda
d) Pendidikan kemahiran dan kerjaya
e) Transformasi pendidikan agama
f) Pendidikan warisan budaya
g) Sejarah pendidikan
h) Hala tuju pendidikan
i) Isu-isu semasa Pendidikan
j) Pendidikan swasta
k) Science, Technology, Engineering and Mathematics (STEM)